早在20世紀(jì)40～50年代，好氧生物處理工藝就應(yīng)用于抗生素制藥廢水的處理，如美國的普強(qiáng)藥廠在1945年就開始進(jìn)行合成制藥廢水好氧生物處理研究，1948年建成廢水處理車間。此后多家藥廠采用生物濾池處理抗生素廢水，惠新藥廠采用*混合加速曝氣法處理高濃度青霉素廢水。20世紀(jì)50～60年代，在美國日本等采用混合稀釋、大量曝氣充氧的活性污泥工藝取得了較好的效果。20世紀(jì)60年代中期到70年代中期，生化處理工藝不斷發(fā)展，在制藥廢水處理中大量應(yīng)用如純氧曝氣、塔式生物濾池、接觸氧化、生物轉(zhuǎn)盤、深井曝氣等專門用于制藥廢水處理的新工藝。進(jìn)入20世紀(jì)80年代后，序批式間歇曝氣活性污泥法(SBR)及其各種變形工藝，如循環(huán)曝氣活性污泥工藝(CASS)、間歇循環(huán)延時(shí)曝氣活性污泥法(ICEAS)等較好的克服了普通活性污泥的缺陷，解決了前述工藝存在的問題。20世紀(jì)80年代，好氧工藝是我國制藥廢水處理工程中的主導(dǎo)工藝，主要工藝有活性污泥法、接觸氧化法、深井曝氣、氧化溝等，1982年在東北制藥總廠建成的80m3的試驗(yàn)用深井曝氣系統(tǒng)，經(jīng)一年多的試驗(yàn)，取得了很好的處理效果。在80年代中后期引發(fā)了一場深井曝氣工藝的熱潮，蘇州*、第二、第四制藥廠，上海第三制藥廠，湖南制藥廠等相繼建成深井曝氣廢水處理工程。據(jù)不*統(tǒng)計(jì)，制藥行業(yè)先后投產(chǎn)了32眼深井。但到80年代末，由于部分深井出現(xiàn)滲漏現(xiàn)象，再加之深井施工難度大，基建費(fèi)用高等問題，深井工藝很快進(jìn)入低潮。

20世紀(jì)90年代初氧化溝工藝曾在合成制藥、抗生素制藥廢水處理中得到應(yīng)用，如上海第四制藥廠、濟(jì)寧抗生素總廠，但是其負(fù)荷低占地面積大的缺點(diǎn)限制了氧化溝的進(jìn)一步，同時(shí)期，接觸氧化法在制藥廢水處理中也得到了比較廣范的應(yīng)用，如華北制藥廠，河北維爾康公司等。接觸氧化法兼有活性污泥法和生物膜法的特點(diǎn)，具有很高的處理負(fù)荷，能夠處理容易引起污泥膨脹的有機(jī)廢水。在制藥工業(yè)生產(chǎn)廢水的處理中，常直接采用接觸氧化法或者厭氧消化、酸化作為預(yù)處理工序，來處理、、維生素C、潔霉素、四環(huán)素以及中藥等制藥生產(chǎn)廢水。但在實(shí)際運(yùn)行中，要保持接觸氧化良好的運(yùn)行效果，通常要求進(jìn)水的COD濃度不大于1000mg/L而且運(yùn)行負(fù)荷也不宜過高，否則會(huì)導(dǎo)致填料結(jié)團(tuán)，影響處理效果。20世紀(jì)90年代中期，SBR/ICEAS工藝在江西東風(fēng)制藥廠和蘇州第二制藥廠得到應(yīng)用，取得了較好的效果。90年代末山東魯抗集團(tuán)從美國引進(jìn)CASS技術(shù)獲得了成功，從而CASS技術(shù)在制藥廢水治理中得到，石家莊制藥集團(tuán)中潤公司、華曙公司、哈爾濱制藥總廠等陸續(xù)引進(jìn)，處理效果普遍較好。進(jìn)入21世紀(jì)后，針對(duì)SBR、CASS等工藝池容利用率偏低等問題，人們又在采用類似三槽式氧化溝、UNITANK以及MSBR等工藝形式處理制藥廢水方面進(jìn)行不斷探索。但是制藥廢水好氧處理通常要求進(jìn)水COD濃度較低，常常需要對(duì)進(jìn)水進(jìn)行稀釋才能取得較好的處理效果，所以越來越多的研究者開始關(guān)注厭氧處理工藝。