鄉鎮衛生院污水處理設備所用工藝必須確保處理出水達標，主要采用的三種工藝有：加強處理效果的一級處理、二級處理和簡易生化處理。醫療廢水中的病原微生物主要有：病原性細菌，腸道病毒、蠕蟲卵和原蟲四類。具體包括沙門氏菌屬痢疾桿菌、霍亂弧菌、致病性大腸桿菌、傳染性肝炎病毒、脊髓灰質炎病毒、柯薩基病毒、蛔蟲卵、鉤蟲卵、血吸蟲卵、阿米巴原蟲。我國大多數醫療廢水中細菌總數每毫升達幾百萬至幾千萬個，其中大腸菌群數每毫升廢水大多在20萬個以上，腸道致病菌檢出率達30%～99%，醫院每天排出成百上千噸含有傳染性病原菌的醫療廢水，這些廢水如不及時處理，通過市政廢水管道進入廢水處理廠后，造成處理后水的質量下降，影響人民身體健康。而對于這些zui危險的多種疾病的潛在傳染源，只有通過 廢水處理，從廢水中檢驗出，才可被發現和制止。防治鄉鎮衛生院污染是醫療廢水防治的要目標。具體而言，就是要使醫療廢水排放達到規定的標準

　　水是維持生態系統良性循環的根本。隨著我國的快速發展，人民生活水平及實力都有所提高，對環保工作的重視和加強已是眾望所歸，建立完善的廢水處理產業可持續發展體系，已成為當務之急。醫療廢水是日常排放量較大，潛在致病危害zui大的廢水之一。醫療廢水中含有多種病菌、病毒及寄生蟲，對這種廢水若不進行治理而直接排放，其直接危害和潛在危害都是顯而易見的，因此，進行衛生院污水治理是十分必要的。

　　鄉鎮衛生院污水處理設備工藝選擇原則為：

　　傳染病醫院必須采用二級處理，并需進行預消毒處理。處理出水排入自然水體的縣及縣以上醫院必須采用二級處理。

　　鄉鎮衛生院污水處理設備還可以適宜住宅小區、醫院療養院、辦公樓、商場、賓館、飯店、機關、學校、*、水產加工廠、牲蓄加工廠、乳品加工廠等生活污水和與之類似的工業有機廢水，如紡織、啤酒、造紙、制革、食品、化工等行業的有機污水處理，主要目的將生活污水和與之相類似的工業有機廢水處理后達到回用水質要求，使廢水處理后資源化利用。

　　鄉鎮衛生院污水處理設備擁有可埋入地表下、全自動控制，不需人員管理、無污泥回流、操作簡單、維護方便、噪聲低，無異味、使用壽命長等特點。